近日,由中国水产科学研究院黄海水产研究所陈松林院士团队构建的海洋硬骨鱼类的综合功能与进化基因组数据库(MFDB)正式上线。这是全球首个面向海洋硬骨鱼类的多组学整合数据库,将为鱼类基因功能解析、进化研究和分子育种提供一站式数据平台。

硬骨鱼类是现存脊椎动物中物种多样性最高的类群之一,涵盖了绝大多数重要海洋经济鱼类。然而,海量基因组、转录组数据长期分散在不同平台,数据标准不统一、功能注释不足,制约了跨物种比较和深度挖掘。MFDB系统整合了来自89个海洋硬骨鱼类物种的染色体级别基因组和3017套高质量转录组,并对231万余个基因进行了统一功能注释。通过整合多个权威数据库,该平台构建了标准化的基因功能注释体系,显著提升了数据的可用性与可比性。
MFDB系统的建成与开放共享,为海洋鱼类基因功能解析、调控网络构建和适应性进化机制研究提供了权威数据资源;通过跨物种比较基因组学分析,有助于揭示硬骨鱼类辐射进化与生态适应的遗传基础。同时,该平台也为生长、抗病、抗逆、性别决定等重要经济性状的基因挖掘与分子标记开发提供了高效工具,有望加速水产良种选育进程。

来源:青岛日报/观海新闻
